第2节. 使用 Centrifuge 分析

Centrifuge 是一个快速检索 reads 的软件,可以用于对微生物样本测序后的宏基因组数据分析。

1. 安装 Centrifuge

# 安装软件
$ git clone https://github.com/infphilo/centrifuge
$ cd centrifuge
$ make
$ sudo make install
# 下载数据库
$ cd indices
$ make b+h+v

2. 使用 Centrifuge