NGS Data Analysis for Pathogens
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序言
第零章. 安装和使用软件
第一章. 基因组数据处理
第二章. 序列比对
第1节. 使用本地 Blast 应用
第2节. 多重序列比对
Reads Mapping
1. bwa
2. bowtie2
3. Soap
4. STAR
Reference
寻找突变位点
第三章. 比较基因组数据分析
第四章. 基因组数据可视化
第五章. 分析工具部署
第六章. Metagenomics数据分析
第七章. Phylogenomics 分析
第八章 Alignment 比对序列
附录内容
NGS Data Analysis for Pathogens
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第二章. 序列比对
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1. bwa
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2. bowtie2
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3. Soap
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4. STAR
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